Vypracovanie protokolov pre molekulovobiologické štúdium faktorov patogenity a virulencie medicínsky významných bakteriálnych patogénov

Projekt bude zameraný na vypracovanie protokolov zameraných na v súčasnosti používané metódy molekulárnej biológie využívané na štúdium faktorov patogenity a virulencie medicínsky významných bakteriálnych patogénov, predovšetkým pôvodcov zoonóz (chorôb prenosných zo zvierat na človeka). Preferovaný spôsob študovania faktorov patogenity a virulencie bakteriálnych patogénov zahŕňa prácu so živými organizmami v prirodzených – in vivo alebo v laboratórnych – in vitro podmienkach. Poznatky o kompletnej nukleotidovej sekvencii genómov takmer všetkých medicínsky významných bakteriálnych patogénov, umožňujú posunúť výskum faktorov patogenity a virulencie na úroveň in silico analýzy (t.j. na základe prác, resp. simulácií na počítači) využitím bioinformatických metód. Nové poznatky o faktoroch patogenity a virulencie medicínsky významných bakteriálnych patogénov, a predovšetkým pôvodcov zo zoonotickým potenciálom, odkrývajú detailný pohľad na mechanizmus patogenézy danej choroby čím sa poskytujú inovatívne možnosti presnejšej a rýchlejšej diagnostiky, efektívnejšej prevencie a terapie. Po vydaní monografie Bioinformatické a molekulovobiologické nástroje pri štúdiu faktorov patogenity a virulencie medicínsky významých bakteriálnych patogénov autormi predkladaného projektu a organizovaní workshopu s vysokou účasťou a pozitívnym ohlasom nielen po jeho ukončení, ale aj v priebehu diskusii k jednotlivým témam vzišla požiadavka o vydanie protokolov reflektujúcich aktuálne potreby v oblasti molekulárnych metód. Rovnako pretrváva záujem zo strany doktorandov i výskumných pracovníkov o zorganizovanie ďalšieho workshopu zameraného na rozšírenie poznatkov o aktuálnych a moderných prístupov sledovania faktorov patogenity na génovej a proteínovej úrovni. Naším cieľom je poskytnúť vedeckej verejnosti (vedeckým a vysokoškolským pracovníkom, doktorandom a študentom) protokoly poskytujúce návody a postupy pre prácu s on-line dostupnými databázami, analýzu získaných dát a ich interpretáciu vo svetle biologicko-medicínskych súvislostí. Protokoly budú okrem návodov bioinformatických prístupov v molekulárnej biológii obsahovať aj v súčasnosti najpoužívanejšie genomické a proteomické postupy. Tento účel bude dosiahnutý prostredníctvom: protokolov pre molekulovobiologické štúdium faktorov patogenity a virulencie medicínsky významných bakteriálnych patogénov. 1. Vydania protokolov s názvom: Protokoly pre molekulovobiologické štúdium faktorov patogenity a virulencie medicínsky významných bakteriálnych patogénov. 2. Organizovania workshopu. 3. Rozšírenie on-line technickej podpory pre prácu s databázami.