ADM The presence of Treponema spp. in equine hoof canker biopsies and skin samples from bovine digital dermatitis lesions. Marčeková, PaulínaMaďar, MariánStyková, EvaKačírová, JanaSondorová, MiriamMudroň, PavolŽert, Zdeněk In Microorganisms 2021, Roč. 9, č. 11, s. 1-10

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Mudroň
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Pavol
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVDr., PhD. , Dip. ECBHM
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/6004
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program všeobecné veterinárske lekárstvo · I. + II. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2021
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	431234
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioFormChildMD6AI&sid=2EFD0E802C0D5BD55F9C41F823&seo=CREP%C4%8C-detail-%C4%8Cl%C3%A1nok
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000724444200001
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	ADM The presence of Treponema spp. in equine hoof canker biopsies and skin samples from bovine digital dermatitis lesions. Marčeková, PaulínaMaďar, MariánStyková, EvaKačírová, JanaSondorová, MiriamMudroň, PavolŽert, Zdeněk In Microorganisms 2021, Roč. 9, č. 11, s. 1-10
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://www.mdpi.com/2076-2607/9/11/2190/htm
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je nositeľom hlavných myšlienok a spolutvorcom výstupu. Zároveň je aj nositeľom finančných prostriedkov projektov z ktorého bol výstup realizovaný.
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Rakovina kopýt koní a digitálna dermatitída hovädzieho dobytka sú infekčné zápalové ochorenia kopýt s neznámou etiológiou. Cieľom tejto štúdie bolo nájsť vhodný spôsob izolácie DNA a zistiť prítomnosť treponemovej DNA vo vzorkách rakoviny kopýt koní a digitálnej dermatitídy hovädzieho dobytka. Prítomnosť Treponema spp. sa zisťovala pomocou PCR a Sangerovho sekvenovania. DNAzol®® Direct je vhodný na izoláciu DNA z týchto typov vzoriek. Treponemová DNA bola zistená vo vzorkách kopýt koní, ako aj vo vzorkách kože pri digitálnej dermatitíde hovädzieho dobytka. V biopsiách kopýt koní sa najčastejšie zistila Treponema pedis (8/13). Zistila sa aj Treponema brennaborense (2/13) a Treponema denticola (2/13). V prípade digitálnej dermatitídy hovädzieho dobytka bola Treponema medium ssp. bovis potvrdená v 14 z 36 vzoriek kože. Zistili sa aj Treponema pedis (9/36), Treponema vincentii (1/36), Treponema phagedenis (1/36) a Treponema brennaborense (1/36). DNAzol®® Direct bol vhodnejší na izoláciu treponemovej DNA, pretože metóda izolácie pomocou kolóniek bola náročnejšia na vybavenie a čas. Vo vzorkách sa stanovila prítomnosť viacerých Treponema spp. U koní bol najčastejšie zisteným druhom T. pedis, zatiaľ čo u hovädzieho dobytka to bola T. medium ssp. bovis.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	Equine hoof canker and bovine digital dermatitis are infectious inflammatory diseases of the hooves with an unknown etiology. The aim of this study was to find a suitable way to isolate DNA and to detect the presence of treponemal DNA in samples of equine hoof canker and bovine digital dermatitis. The presence of Treponema spp. was detected using PCR and Sanger sequencing. DNAzol®® Direct is suitable for isolating DNA from these types of samples. Treponemal DNA was detected in equine hoof samples as well as in bovine digital dermatitis skin samples. In equine hoof biopsies, the most frequently detected was Treponema pedis (8/13). Treponema brennaborense (2/13) and Treponema denticola (2/13) were also found. In the case of bovine digital dermatitis, Treponema medium ssp. bovis was confirmed in 14 of 36 skin samples. Treponema pedis (9/36), Treponema vincentii (1/36), Treponema phagedenis (1/36), and Treponema brennaborense (1/36) were detected as well. DNAzol®® Direct was more appropriate for isolation of treponemal DNA because the columns isolation method was more equipment and time-consuming. The presence of several Treponema spp. was determined in the samples. In horses, the most commonly detected species was a T. pedis, while in cattle it was T. medium ssp. bovis.
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Izolácia DNA pomocou DNAzol®® Direct, PCR, Sangerovo sekvenovanie a genotypizácia sú vhodné na zistenie etiologických pôvodcov rakoviny kopýt koní a digitálnej dermatitídy hovädzieho dobytka. V tejto štúdii sa vo vzorkách rakoviny kopýt koní a digitálnej dermatitídy hovädzieho dobytka zistilo niekoľko druhov Treponema. T. pedis bol najčastejšie zisteným druhom u koní. T. medium ssp. bovis a T. pedis boli časté u hovädzieho dobytka. Budúce analýzy BDD alebo rakoviny kopýt koní by sa mohli zamerať na iné typy vzoriek, ktoré by mohli byť potenciálnym zdrojom Treponema spp. ako napríklad vzorky výkalov z konečníka, vzorky výkalov nad léziou, rôzne vrstvy kože a iné.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Publikácia je vhodnou študijnou literatúrou pre študentov študijného programu všeobecné veterinárske lekárstvo.