Genetic variability of pig and human rotavirus group A isolates from Slovakia / Slavomíra Šalamúnová, Anna Jacková, Tomáš Csank, René Mandelík, Jaroslav Novotný, Zuzana Becková, Lenka Helmová, Štefan Vilček. In Archives of virology. - ISSN 0304-8608. - Vol. 165, no. 2 (2020), p. 463-470. (2019: 2.243 - IF, 2.176 - IF 5y, 107 - H-index, 0.933 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q3

Genetic variability of pig and human rotavirus group A isolates from Slovakia / Slavomíra Šalamúnová, Anna Jacková, Tomáš Csank, René Mandelík, Jaroslav Novotný, Zuzana Becková, Lenka Helmová, Štefan Vilček. In Archives of virology. - ISSN 0304-8608. - Vol. 165, no. 2 (2020), p. 463-470. (2019: 2.243 - IF, 2.176 - IF 5y, 107 - H-index, 0.933 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q3 - JCR Best Q)

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Csank
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Tomáš
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	doc. MVDr., PhD.
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/6133
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program mikrobiológia a imunológia · III. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2020
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	177674
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioFormChildCJ61F&sid=D51643D01657CDEC2892DCE672&seo=CREP%C4%8C-detail-%C4%8Cl%C3%A1nok
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85077059168&origin=resultslist
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	Genetic variability of pig and human rotavirus group A isolates from Slovakia / Slavomíra Šalamúnová, Anna Jacková, Tomáš Csank, René Mandelík, Jaroslav Novotný, Zuzana Becková, Lenka Helmová, Štefan Vilček. In Archives of virology. - ISSN 0304-8608. - Vol. 165, no. 2 (2020), p. 463-470. (2019: 2.243 - IF, 2.176 - IF 5y, 107 - H-index, 0.933 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q3 - JCR Best Q)
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://link.springer.com/article/10.1007/s00705-019-04504-6
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je spolunositeľom myšlienok a spolu riešiteľom celého výskumu v danej oblasti.
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Cieľom tejto práce bola genetická typizácia izolátov RVA pochádzajúcich z ošípaných a ľudských pacientov na Slovensku. Odobratých bolo 78 rektálnych výterov od domácich ošípaných a 30 vzoriek stolice od ľudí. Pomocou RT-PCR sa amplifikovali celé ORF VP7 (genotypy G), VP6 (genotypy I) a čiastočné ORF VP4 (genotypy P). Genetická variabilita bola vyššia medzi sekvenciami ošípaných, kde sa zistili štyri genotypy G (G3, G4, G5, G11), dva genotypy P (P[6], P[13]) a jeden genotyp I5. Ľudské kmene RVA boli zastúpené dvoma genotypmi G (G1, G3), dvoma genotypmi I (I1, I2) a jedným genotypom P (P[8]).
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	The aim of this work was the genetic typing of RVA isolates from pig and human patients in Slovakia. Seventy-eight rectal swabs from domestic pigs and 30 stool samples from humans were collected. Using RT-PCR, whole ORF VP7 (G genotypes), VP6 (I genotypes) and partial ORF VP4 (P genotypes) were amplified. Genetic variability was higher among pig sequences, where four G genotypes (G3, G4, G5, G11), two P genotypes (P[6], P[13]) and one I5 genotype were detected. Human RVA strains were represented by two G genotypes (G1, G3), two I genotypes (I1, I2) and one P genotype (P[8]).
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup	1. Morozova O.V., Sashina T.A., Epifanova N.V., Velikzhanina E.I., Novikova N.A. Phylodynamic characteristics of reassortant DS-1-like G3P[8]-strains of rotavirus type A isolated in Nizhny Novgorod (Russia) 2023 Brazilian Journal of Microbiology 54 4 2867 2877; 10.1007/s42770-023-01155 2. Lagan P., Mooney M.H., Lemon K. Genome analyses of species A rotavirus isolated from various mammalian hosts in Northern Ireland during 2013−2016 2023 Virus Evolution 9 2 vead03; 10.1093/ve/vead039 3. Petrusha O.A., Korchevaya E.R., Mintaev R.R., Nikonova A.A., Isakov I.Yu., Meskina E.R., Ushakova A.Yu., Khadisova M.K., Zverev V.V., Faizuloev E.B. Molecular and genetic characteristics of group A rotaviruses detected in Moscow in 2015-2020 2022 Zhurnal Mikrobiologii Epidemiologii i Immunobiologii 99 1 7 19; 10.36233/0372-9311-208 4. Katz E.M., Esona M.D., Gautam R., Bowen M.D. Development of a Real-Time Reverse Transcription-PCR Assay to Detect and Quantify Group A Rotavirus Equine-Like G3 Strains 2021 Journal of Clinical Microbiology 59 11 e02602-20; 10.1128/JCM.02602-20
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Pozorovalo sa fylogenetické zoskupenie niektorých slovenských prasacích sekvencií s maďarskými ľudskými sekvenciami v genotypoch G aj P.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Získané údaje budú využité v pedagogickom procese a v rámci postgraduálneho vzdelávania na 3. stupni štúdia, resp. vzdelávania veterinárnych lekárov.