ADC Assessment of two different methods for sampling and detection of Dichelobacter nodosus and Fusobacterium necrophorum in dairy cows in Eastern Slovakia. Segurado Benito Pilipčincová, IvanaKirály, JánDolník, MichalOsová, AdrianaMudroň, Pavol. In Journal of Applied Animal Research 2018, Roč. 46, č. 1, s. 1452-1456

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Mudroň
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Pavol
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVDr., PhD. , Dip. ECBHM
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/6004
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program vnútorné choroby zvierat · III. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2018
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	97532
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioForm&sid=057E6E723D4374EE26A4A0B6
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85063991901&origin=resultslist&sort=plf-f&src=s&nlo=&nlr=&nls=&sid=64150edc57660b307f2b2f1b9b34e23b&sot=b&sdt=b&sl=23&s=AUTHOR-NAME+%28Mudron+P.%29&relpos=10&citeCnt=2&searchTerm=
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	ADC Assessment of two different methods for sampling and detection of Dichelobacter nodosus and Fusobacterium necrophorum in dairy cows in Eastern Slovakia. Segurado Benito Pilipčincová, IvanaKirály, JánDolník, MichalOsová, AdrianaMudroň, Pavol. In Journal of Applied Animal Research 2018, Roč. 46, č. 1, s. 1452-1456
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/09712119.2018.1532903
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je nositeľom hlavných myšlienok a spolutvorcom výstupu. Zároveň je aj nositeľom finančných prostriedkov projektov z ktorého bol výstup realizovaný.
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Cieľom našej štúdie bolo nájsť najvhodnejší spôsob odberu vzoriek z končatín hovädzieho dobytka, ako aj posúdiť jednoduché a efektívne spracovanie vzorky vrátane extrakcie DNA na spoľahlivú diagnostiku baktérií Dichelobacter nodosus a Fusobacterium necrophorum. Do štúdie bolo zaradených 11 klinicky zdravých kráv, z ktorých boli odobraté vzorky pomocou tampónov (2 typy: povrchový tampón a hlboký tampón). Na extrakciu DNA sa použili dve izolačné metódy: 1. zmrazenie a varenie vzoriek, 2. komerčný kit (Roche). PCR analýza vzoriek nepreukázala žiadne variácie v detekčnom pomere D. nodosus a F. necrophorum pri rôznych metódach výterov. Najvyššia citlivosť detekcie oboch baktérií bola dosiahnutá kultiváciou vzoriek v AB s následnou extrakciou DNA zmrazením a varom. Kultivácia v anaeróbnom bujóne mala za následok detekciu D. nodosus a F. necrophorum vo viac ako 95 %, respektíve 27 %. Na záver možno povedať, že jednoduchý „povrchový“ tampón postačuje na detekciu študovaných patogénov, pričom najvhodnejšou metódou extrakcie DNA sa ukázalo zmrazenie a varenie vzorky.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	The aim of our study was to find the most appropriate way of sample collection from cattle feet as well as to assess simple and effective sample processing, including DNA extraction for reliable diagnosis of bacteria Dichelobacter nodosus and Fusobacterium necrophorum. 11 clinically healthy cows were included in the study, from which swabbing samples (2 types: surface swab and deep swab) were taken. Two isolation methods were used for DNA extraction: 1. freezing and boiling the samples, 2. commercial kit (Roche). PCR analysis of the samples has not shown any variations in the detection ratio of D. nodosus and F. necrophorum at different swabbing methods. The highest sensitivity of the detection of both bacteria was reached with a cultivation of samples in AB with subsequent extraction of DNA with freezing and boiling. The cultivation in anaerobic broth resulted in the detection rate of D. nodosus and F. necrophorum in over 95% and 27%, respectively. To conclude, the simple ‘surface’ swab is sufficient to detect studied pathogens, the most appropriate method of DNA extraction has proven to be freezing and boiling of the sample.
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Výstup štúdie je orientovaný na chovateľov hovädzieho dobytka a veterinárnych lekárov, ktorí ich môžu použiť pri diagnostike chorôb paznechtov, najmä pri diferenciácii infekčných a neinfekčných foriem.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Výstup štúdie je využívaný vo výučbe Chorôb prežúvavcov a Manažmente zdravia stáda.