ADC Comparison of methods for measuring protein concentration in venom samples / Aleksandra Bocian, Sonja Slawek, Marcin Jaromin, Konrad Kamil Hus, Justyna Buczkowicz, Dawid Lysiak, Vladimír Petrilla, Monika Petrillová, Jaroslav Legáth. In Animals. - ISSN 2076-2615. - Vol. 10, no. 3 (2020), art. no. 448, p. [1-9]. (2019: 2.323 - IF, 28 - H-index, 0.601 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1

ADC Comparison of methods for measuring protein concentration in venom samples / Aleksandra Bocian, Sonja Slawek, Marcin Jaromin, Konrad Kamil Hus, Justyna Buczkowicz, Dawid Lysiak, Vladimír Petrilla, Monika Petrillová, Jaroslav Legáth. In Animals. - ISSN 2076-2615. - Vol. 10, no. 3 (2020), art. no. 448, p. [1-9]. (2019: 2.323 - IF, 28 - H-index, 0.601 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q).

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Legáth
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Jaroslav
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVDr., CSc.
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/2269
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program farmácia (spoločný študijný program) · I. + II. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2020
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	187866
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioFormChildEGB7&sid=CB4D57913478E3D227CFD6734D&seo=CREP%C4%8C-detail-%C4%8Cl%C3%A1nok
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.webofscience.com/wos/woscc/full-record/WOS:000529378800081
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	ADC Comparison of methods for measuring protein concentration in venom samples / Aleksandra Bocian, Sonja Slawek, Marcin Jaromin, Konrad Kamil Hus, Justyna Buczkowicz, Dawid Lysiak, Vladimír Petrilla, Monika Petrillová, Jaroslav Legáth. In Animals. - ISSN 2076-2615. - Vol. 10, no. 3 (2020), art. no. 448, p. [1-9]. (2019: 2.323 - IF, 28 - H-index, 0.601 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q).
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://www.mdpi.com/2076-2615/10/3/448/htm
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Koordinátor vedeckého tímu
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Hadí jed sa skladá prevažne z proteínov a peptidov, ktoré sú pre svoje potenciálne farmakologické vlastnosti predmetom záujmu mnohých výskumníkov. Vzhľadom na ich biochemický charakter sa tieto zložky analyzujú pomocou proteomických techník, ako sú elektroforéza, chromatografia a hmotnostná spektrometria. Veľmi dôležitou fázou takýchto štúdií je meranie koncentrácie proteínov vo vzorke, ktoré sa najčastejšie vykonáva kolorimetrickými metódami. V predkladanom článku sme použili päť takýchto techník na jedoch dvoch druhov hadov, a to Agkistrodon contortrix a Naja ashei. V prípade jedu A. contortrix poskytujú štyri metódy podobné hodnoty koncentrácie, zatiaľ čo v prípade N. ashei sú rozdiely medzi výsledkami veľmi výrazné. Zdroj týchto rozdielov treba pravdepodobne vidieť v rozdieloch v aminokyselinovom zložení bielkovín týchto dvoch jedov. Touto správou by sme chceli upozorniť na potrebu výberu vhodnej metódy merania koncentrácie bielkovín v jede, najmä v prípade druhov rodu Elapid.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	Snake venom is an extremely interesting natural mixture of proteins and peptides, characterized by both high diversity and high pharmacological potential. Much attention has been paid to the study of venom composition of different species and also detailed analysis of the properties of individual components. Since proteins and peptides are the active ingredients in venom, rapidly developing proteomic techniques are used to analyze them. During such analyses, one of the routine operations is to measure the protein concentration in the sample. The aim of this study was to compare five methods used to measure protein content in venoms of two snake species: the Viperids representative, Agkistrodon contortrix, and the Elapids representative, Naja ashei. The study showed that for A. contortrix venom, the concentration of venom protein measured by four methods is very similar and only the NanoDrop method clearly stands out from the rest. However, in the case of N. ashei venom, each technique yields significantly different results. We hope that this report will help to draw attention to the problem of measuring protein concentration, especially in such a complex mixture as animal venoms.
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup	ElSaboni, Y., Hunt, J.A., Stanley, J., Moffatt, C., Wei, Y.Development of a textile based protein sensor for monitoring the healing progress of a wound(2022) Scientific Reports, 12 (1), art. no. 7972 Okumu, M.O., Mbaria, J.M., Gikunju, J.K., Mbuthia, P.G., Madadi, V.O., Ochola, F.O., Maloba, K.N., Nderitu, J.G.Preclinical efficacy testing of three antivenoms against Naja ashei venom-induced lethality(2022) Toxicon: X, 14, art. no. 100124 Marrugo-Padilla, A., Méndez-Cuadro, D., Rodríguez-Cavallo, E.Tetracycline residues induce carbonylation of milk proteins and alter their solubility and digestibility(2022) International Dairy Journal, 125, art. no. 105226 Lemauf, S., Cazes, D., Poirié, M., Gatti, J.-L.Amount of venom that Leptopilina species inject into Drosophila melanogaster larvae in relation to parasitic success(2021) Journal of Insect Physiology, 135, art. no. 104320 Hus, K.K., Marczak, Ł., Petrilla, V., Petrillová, M., Legáth, J., Bocian, A.Different research approaches in unraveling the venom proteome of naja ashei(2020) Biomolecules, 10 (9), art. no. 1282, pp. 1-12
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Zo získaných údajov nie je ľahké rozhodnúť, ktorá metóda je najpresnejšia pri určovaní koncentrácie jedového proteínu, pretože nepoznáme jeho skutočnú hodnotu. V prípade jedu A. contortrix však štyri metódy poskytli podobné výsledky, ktoré sa pohybovali v rozmedzí 50 µg/µl. Iba metóda, ktorá je založená na priamom meraní absorbancie pri 280 nm, poskytla výrazne odlišnú hodnotu. Domnievame sa, že takýto výrazný rozdiel môže byť spôsobený naším predpokladom, že extinkčný koeficient oboch zmesí jedových proteínov je 10, čo je štandardný postup pri neznalosti tohto parametra; mohol by však do značnej miery ovplyvniť konečné vypočítané hodnoty, najmä ak je skutočná hodnota tohto faktora veľmi odlišná od akceptovanej. Na druhej strane, v prípade jedu N. ashei je rozptyl údajov taký veľký, že z neho nemožno vyvodiť žiadne závery. Nie je úplne jasné, prečo tieto rozdiely vznikajú; hlavnou príčinou by však mohli byť rozdielne primárne sekvencie proteínov, ktoré tvoria hadie jedy, keďže dostupné metódy na stanovenie koncentrácie proteínov sú veľmi závislé od obsahu jednotlivých aminokyselín vo vzorke. Preto je vždy vhodné zohľadniť zloženie bielkovín analyzovaného jedu a vypočítané hodnoty prijímať s opatrnosťou.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Poznatky prezentované v článku sú využívané v pedagogickom procese, publikácia je vhodným doplnkovým študijným materiálom pre študentov ŠP farmácia.