ADC TKÁČIKOVÁ, Ľudmila - MOCHNÁČOVÁ, Evelína - PUNIT, Tyagi - KIŠŠOVÁ, Zuzana - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the cell response to E. coli infection in porcine intestinal epithelial cells pretreated with exopolysaccharide derived from Lactobacillus reuteri. In Veterinary Research. ISSN 0928-4249, 2020, vol. 51, no. 1, art. no. 49, p. [1-13]. (2019: 3.357 - IF, 3.432 - IF 5y, 99 - H-index, 1.425 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1

ADC TKÁČIKOVÁ, Ľudmila - MOCHNÁČOVÁ, Evelína - PUNIT, Tyagi - KIŠŠOVÁ, Zuzana - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the cell response to E. coli infection in porcine intestinal epithelial cells pretreated with exopolysaccharide derived from Lactobacillus reuteri. In Veterinary Research. ISSN 0928-4249, 2020, vol. 51, no. 1, art. no. 49, p. [1-13]. (2019: 3.357 - IF, 3.432 - IF 5y, 99 - H-index, 1.425 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q).

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Tkáčiková
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Ľudmila
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVDr., PhD.
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/5991
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program mikrobiológia a imunológia · III. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2020
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	182500
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://arl4.library.sk/arl-uvlk/sk/detail-uvlk_un_cat-0034157-Comprehensi
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://arl4.library.sk/arl-uvlk/sk/detail-uvlk_un_cat-0034157-Comprehensive-mapping-of-the-cell-response-to-E-coli-infection-in-porcine-intestinal-epithelial-cel/?disprec=1&iset=7
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	ADC TKÁČIKOVÁ, Ľudmila - MOCHNÁČOVÁ, Evelína - PUNIT, Tyagi - KIŠŠOVÁ, Zuzana - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the cell response to E. coli infection in porcine intestinal epithelial cells pretreated with exopolysaccharide derived from Lactobacillus reuteri. In Veterinary Research. ISSN 0928-4249, 2020, vol. 51, no. 1, art. no. 49, p. [1-13]. (2019: 3.357 - IF, 3.432 - IF 5y, 99 - H-index, 1.425 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q).
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://veterinaryresearch.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13567-020-00773-1.pdf
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je nositeľom hlavných myšlienok a spolutvorcom výstupu. Zároveň je tiež nositeľom finančných prostriedkov projektu VEGA, z ktorého bol výstup realizovaný.
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Je známe, že bakteriálne exopolysacharidy (EPS) modulujú imunitu. Doteraz sa v mnohých štúdiách uvádzali však len málo prác odhalilo úplný obraz signalizačných udalostí v epitelových bunkách čreva vyvolaných bakteriálnymi EPS. Pomocou transkriptomiky sme komplexne zmapovali biologické procesy v epitelových bunkách čriev ošípaných, ktoré boli vystavené pôsobeniu EPS pochádzajúcich zo samotného Lactobacillus reuteri, enterotoxigénnych Escherichia coli (ETEC) alebo ETEC po predbežnom ošetrení s EPS. Analýza génovej ontológie diferenciálne exprimovaných génov (DEG) ukázala, že ETEC čelenž aktivuje biologické procesy, ktoré sa špecificky podieľajú na reorganizácií bunkových spojení, degradácii extracelulárnej matrix a aktivácii vrodenej imunitnej odpovede prostredníctvom aktivácie receptorov rozpoznávania vzorov, ako sú TLR a CTR. V bunkách čelenžovaných ETEC bolo indukovalných celkovo 495 DEG. Na druhej strane, predbežné ošetrenie buniek s EPS dokázalo zmierniť nadmernú expresiu génov indukovaných infekciou ETEC. Najdôležitejším zistením tejto štúdie je, že EPS má inhibičný účinok na zápalovú reakciu vyvolanú infekciou ETEC. Na základe vysoko výkonného RNA-seq je táto správa prvou, ktorá opisuje účinky EPS odvodených z L. reuteri použitých ako predliečba na globálnu expresiu génov v epitelových bunkách ošípaných.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	Bacterial exopolysaccharides (EPSs) are known to modulate immunity. To date, a plethora of studies have reported the effect of EPSs on intestinal cells; however few works have revealed a complete picture of the signalling events in intes- tinal epithelial cells induced by bacterial EPSs. Here, using transcriptomics, we comprehensively mapped the biologi- cal processes in porcine intestinal epithelial cells challenged with EPS derived from Lactobacillus reuteri alone, entero- toxigenic Escherichia coli (ETEC) or ETEC after pretreatment with EPS. The Gene Ontology analysis of differentially expressed genes (DEGs) showed that ETEC is able to evoke biological processes specifically involved in cell junction reorganization, extracellular matrix degradation, and activation of the innate immune response through the activation of pattern recognition receptors, such as TLRs and CTRs. A total of 495 DEGs were induced in ETEC-challenged cells. On the other hand, EPS pretreatment was able to attenuate overexpression of the genes induced by ETEC infection. The most relevant finding of this study is that EPS has a suppressive effect on the inflammatory response evoked by ETEC infection. On the basis of high-throughput RNA-seq, this report is the first to describe the effects of EPSs derived from L. reuteri used as a pretreatment of global gene expression in porcine epithelial cells.
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup	YANG, S. et al. Exopolysaccharides from lactic acid bacteria, as an alternative to antibiotics, on regulation of intestinal health and the immune system. In Animal Nutrition [online]. 2023, roč. 13, s. 78 – 89. Dostupné na: doi:10.1016/j.aninu.2023.02.004 YU, Z. et al. The role of potential probiotic strains Lactobacillus reuteri in various intestinal diseases: New roles for an old player. In Frontiers in Microbiology [online]. 2023, roč. 14. Dostupné na: doi:10.3389/fmicb.2023.1095555 WERNING, M.L. et al. Biological Functions of Exopolysaccharides from Lactic Acid Bacteria and Their Potential Benefits for Humans and Farmed Animals. In Foods [online]. 2022, roč. 11, č. 9. Dostupné na: doi:10.3390/foods11091284 ZAYED, A. et al. Rediscovering bacterial exopolysaccharides of terrestrial and marine origins: novel insights on their distribution, biosynthesis, biotechnological production, and future perspectives. In Critical Reviews in Biotechnology [online]. 2022, roč. 42, č. 4, s. 597 – 617. Dostupné na: doi:10.1080/07388551.2021.1942779 WU, Q. et al. Transcriptome Analysis Identifies Strategies Targeting Immune Response-Related Pathways to Control Enterotoxigenic Escherichia coli Infection in Porcine Intestinal Epithelial Cells. In Frontiers in Veterinary Science [online]. 2021, roč. 8. Dostupné na: doi:10.3389/fvets.2021.677897
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Výstup prináša nové poznatky o možnostiach využitia exopolysacharidov produkovaných probiotickými baktériami Lactobacillus reuteri pri ovplyvnení zápalu gastrointestinálneho traktu (GIT) prasiat vyvolaného enterotoxigénnymi kmeňmi E. coli.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Výstup bude využitý pri transfere poznatkov v oblasti imunológie – pri štúdiu imunitnej odpovede v gastrointestinálnom trakte (GIT) prasiat.