Differential transcriptome response of blood brain barrier spheroids to neuroinvasive Neisseria and Borrelia/Kulkarni Amod, Jozefiaková Jana, Bhide Katarína, Mochnáčová Evelína, Bhide Mangesh

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Bhide
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Mangesh Ramesh
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVSc., PhD.
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/6102
OCA5. Oblasť posudzovania	študijný program mikrobiológia a imunológia · III. stupeň
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2023
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	1116774
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioFormChildC2VQT1&sid=82E8E2F14D9232B3C0ACA36D4D93&seo=CREPČ-detail-Článok
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.frontiersin.org/journals/cellular-and-infection-microbiology/articles/10.3389/fcimb.2023.1326578/full
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	Differential transcriptome response of blood brain barrier spheroids to neuroinvasive Neisseria and Borrelia/Kulkarni Amod, Jozefiaková Jana, Bhide Katarína, Mochnáčová Evelína, Bhide Mangesh
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://www.frontiersin.org/journals/cellular-and-infection-microbiology/articles/10.3389/fcimb.2023.1326578/full
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je nositeľom myšlienok a hlavným riešiteľom celého výskumu v danej oblasti / The
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	Samoskladajúce sa sféroidy boli použité na vnímanie BBB reakcie na neuroinvazívne patogény - Neisseria a Borrelia. Ohrozená integrita sféroidov počas infekcie Neisseria a Borrelia na rozdiel od ich neporušenosti a nepriľnavosti E. coli (neneuroinvazívne) označuje patogénne závislý osud BBB. Gény kategorizované do rôznych biologických funkcií indikovali oslabené bariérové vlastnosti BBB a zvýšenú vrodenú imunitnú odpoveď. Inverzná expresia 48 % génov bežne identifikovaných počas infekcie Neisseria a Borrelia je príkladom jedinečnej odpovede BBB na rôzne neuropatogény.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	The output elucidates the biological processes taking place in brain endothelial cells after their induction by Streptococcus pneumoniae (SP) and its ligand laminin binding protein. Data from transcriptome analysis were processed using innovative bioinformatics tools. The elucidation of cell transcriptome forms the basis for understanding the process of SP translocation across the blood-brain barrier. These findings can be used in the development of ligand-blocking therapeutic agents
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Vystup objasňuje biologické procesy prebiehajúce v mozgových endotelových bunkách po ich indukcii .Dáta z transkriptómovej analýzy boli spracované pomocou inovatívnych bioinformatických nástrojov. Objasnenie transkriptómu buniek vytvára základňu pre pochopenie procesu translokácie SP cez hematoencefalickú bariéru. Tieto poznatky môžu byť využité pri vývoji ligand-blokujúcich terapeutických látok.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Výstup popisuje metódy kultivácie a indukcie endotelových buniek SP, ako aj spôsob izolácie a spracovanie RNA na RNA sekvenovanie. Transkritptómová analýza bola vykonaná pomocou inovatívnych bioinformatických nástrojov. Všetky novodobé postupy uvedené v tomto výstupe môžu byť aplikované v edukačnom procese ako vzor pre biologické spracovávanie vzoriek, ako aj analýzu transkriptómových dát / The output describes methods of culturing and inducing SP endothelial cells, as well as a method of isolating and processing RNA for RNA sequencing. Transcriptome analysis was performed using innovative bioinformatics tools. All modern procedures presented in this output can be applied in the educational process as a model for biological processing of samples, as well as the analysis of transcriptome data