BHIDE, Katarína - SLÁVIKOVÁ, Monika - TALPAŠOVÁ, Lea - KUCKOVÁ, Katarína - KLEMPA, Boris - TYAGI, Punit - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the signaling events evoked by SARS-CoV-2 variants delta and omicron in human astrocytes. In: Scientific Reports. 2025. ISSN 2045-2322, Vol. 15, no. 1 (2025), art. no. 36897, p. [1-18] (2024: 3.900 - IF, 347 - H-index, 4.300 - IF 5y, 0.874 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1

BHIDE, Katarína - SLÁVIKOVÁ, Monika - TALPAŠOVÁ, Lea - KUCKOVÁ, Katarína - KLEMPA, Boris - TYAGI, Punit - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the signaling events evoked by SARS-CoV-2 variants delta and omicron in human astrocytes. In: Scientific Reports. 2025. ISSN 2045-2322, Vol. 15, no. 1 (2025), art. no. 36897, p. [1-18] (2024: 3.900 - IF, 347 - H-index, 4.300 - IF 5y, 0.874 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q)

Základné údaje
OCA1. Priezvisko hodnotenej osoby	Bhide
OCA2. Meno hodnotenej osoby	Mangesh Ramesh
OCA3. Tituly hodnotenej osoby	prof. MVSc., PhD.
OCA4. Hyperlink na záznam osoby v Registri zamestnancov vysokých škôl	https://www.portalvs.sk/regzam/detail/6102
OCA5. Oblasť posudzovania	habilitačné a inauguračné konanie – mikrobiológia a imunológia
OCA6. Kategória výstupu tvorivej činnosti	vedecký výstup
OCA7. Rok vydania výstupu tvorivej činnosti	2025
OCA8. ID záznamu v CREPČ alebo CREUČ (ak je)	ID = 1457840
OCA9. Hyperlink na záznam v CREPČ alebo CREUČ	https://app.crepc.sk/?fn=detailBiblioForm&sid=0278C0DD79B92F655A5864236996
Charakteristika výstupu, ktorý nie je registrovaný v CREPČ alebo CREUČ
OCA10. Hyperlink na záznam v inom verejne prístupnom registri, katalógu výstupov tvorivých činností	https://www.scopus.com/pages/publications/105019590634?origin=resultslist
OCA11. Charakteristika výstupu vo formáte bibliografického záznamu CREPČ alebo CREUČ, ak výstup nie je vo verejne prístupnom registri alebo katalógu výstupov	BHIDE, Katarína - SLÁVIKOVÁ, Monika - TALPAŠOVÁ, Lea - KUCKOVÁ, Katarína - KLEMPA, Boris - TYAGI, Punit - BHIDE, Mangesh Ramesh. Comprehensive mapping of the signaling events evoked by SARS-CoV-2 variants delta and omicron in human astrocytes. In: Scientific Reports. 2025. ISSN 2045-2322, Vol. 15, no. 1 (2025), art. no. 36897, p. [1-18] (2024: 3.900 - IF, 347 - H-index, 4.300 - IF 5y, 0.874 - SJR, Q1 - SJR Best Q, Q1 - JCR Best Q)
OCA12. Typ výstupu (ak nie je výstup registrovaný v CREPČ alebo CREUČ)	článok
OCA13. Hyperlink na stránku, na ktorej je výstup sprístupnený (úplný text, iná dokumentácia a podobne)	https://www.nature.com/articles/s41598-025-20851-8
OCA14. Charakteristika autorského vkladu	Autor je nositeľom myšlienok a hlavným riešiteľom celého výskumu v danej oblasti.
OCA15. Anotácia výstupu s kontextovými informáciami týkajúcimi sa opisu tvorivého procesu a obsahu tvorivej činnosti a pod.	COVID-19 spôsobuje širokú škálu komplikácií v centrálnom nervovom systéme vrátane encefalitídy a ďalších neurologických symptómov, ako sú problémy s pamäťou, psychické poruchy, depresia a úzkosť. Predkladáme komplexné údaje o zmenách v génovej expresie v astrocytoch infikovaných variantmi SARS-CoV-2 Delta alebo Omicron. V údajoch RNA-seq sme zistili 346 génov, ktoré boli významne evokované (197 up- a 149 down-regulovaných) v astrocytoch vystavených variantu Omicron v porovnaní s 341 evokovanými génmi (215 up- a 126 down-regulovaných) vo variante Delta. Prekvapivo veľký počet génov bol výlučne evokovaný variantmi Delta (82 up- a 48 down-regulovaných) a Omicron (65 up- a 60 down-regulovaných). Početné dráhy, vrátane tých, ktoré sa týkajú neuronálneho systému, metabolizmu, reakcie na vírusovú infekciu, signálnej transdukcie, cytokínovej signalizácie a homeostázy, boli v infikovaných astrocytoch dysregulované. V tejto správe sme rozobrali hlavné dráhy, ktoré súvisia s rozpoznávaním patogénov, integritou hematopoetickej bariéry (HBB) a gliových limitans a neurologickými poruchami, ktoré by mohli viesť k vyššie uvedeným neurologickým symptómom. Naše zistenia tiež odhaľujú dysreguláciu veľkého počtu nekódujúcich RNA. Údaje prezentované v tomto dokumente nám môžu pomôcť lepšie pochopiť úlohu astrocytov pri neurologických poruchách pozorovaných u pacientov s COVID-19.
Ostatné údaje
OCA16. Anotácia výstupu v anglickom jazyku	COVID-19 causes a wide range of complications in the central nervous system, including encephalitis and other neurological symptoms such as memory problems, psychological disorders, depression, and anxiety. We present comprehensive data on the changes in gene expression levels in astrocytes infected with the Delta or Omicron variants of SARS-CoV-2. In RNA-seq data, we found 346 genes that were significantly evoked (197 up- and 149 down-regulated) in astrocytes challenged with the Omicron variant, compared to 341 evoked genes (215 up- and 126 down-regulated) in the Delta variant. A surprisingly large number of genes were exclusively evoked by Delta (82 up- and 48 downregulated) and Omicron variants (65 up and 60 downregulated). Numerous pathways, including those pertaining to the neuronal system, metabolism, response to viral infection, signal transduction, cytokine signaling, and homeostasis, were dysregulated in infected astrocytes. In this report we have dissected major pathways that are related to pathogen recognition, integrity of the BBB and glia limitans, and neurological disorders that could lead to neurological symptoms listed above. Our findings also reveal dysregulation of a large number of non-coding RNAs. The data presented here may help us better understand the role of astrocytes in the neurological disorders seen in COVID-19 patients.
OCA17. Zoznam najviac 5 najvýznamnejších ohlasov na výstup
OCA18. Charakteristika dopadu výstupu na spoločensko-hospodársku prax	Objasnenie vplyvu SARS-CoV-2 na funkčnosť astrocytov a čiastocné objasnenie neurologických príznakov COVID-19.
OCA19. Charakteristika dopadu výstupu a súvisiacich aktivít na vzdelávací proces	Štúdium a pochopenie neuroinfekcie spôsobenej SARS-CoV-2.